El laboratorio de Microbiología de Aguas y Alimentos ofrece servicios de análisis microbiológico para todo tipo de alimento y agua. Además, ofrece los servicios de investigación a nivel industrial, con el fin de determinar la o las causas de deterioro de diversos productos así como la posible solución a éste.

Por otro lado, ofrece a la industria alimentaria la determinación de la efectividad de desinfectantes, evaluación de higiene, evaluación de ambientes.